Vediamo se ho capito: in pratica tu hai un grande file MP3 in cui vi sono svariate tracce, e le vuoi separare, giusto? Un ottimo programma per la modifica dei file audio è
Audacity, freeware e flessibile: con questo potrai aprire il file, selezionare le parti che ti interessano e dal menu File cliccare su "Esporta selezione", con cui potrai salvare ogni singola canzone.